43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0223 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  62.87 
 
 
214 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  48.26 
 
 
208 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  46.86 
 
 
207 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  44.6 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  41.9 
 
 
208 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  24.75 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  26.44 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  36.99 
 
 
83 aa  62  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  32.89 
 
 
82 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  31.08 
 
 
81 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  36 
 
 
82 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  34.67 
 
 
82 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  37.14 
 
 
83 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  39.73 
 
 
75 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  37.33 
 
 
82 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  40.58 
 
 
81 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  32.86 
 
 
99 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  34.29 
 
 
84 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  32.86 
 
 
84 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  32.86 
 
 
84 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  32.86 
 
 
84 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  32.86 
 
 
82 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  36.23 
 
 
82 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  40.28 
 
 
85 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 
84 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  41.79 
 
 
79 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  38.57 
 
 
81 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  37.5 
 
 
81 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  36.76 
 
 
84 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  38.81 
 
 
83 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  39.71 
 
 
80 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  36.99 
 
 
84 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>