34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2460 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  47.6 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  47.6 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  41.63 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  43.06 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  41.9 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  46.05 
 
 		 84 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  44.74 
 
 		 82 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  46.05 
 
 		 82 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  46.05 
 
 		 84 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  44.16 
 
 		 84 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  46.05 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  44.74 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  44.74 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  44.74 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  45.07 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  46.27 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  42.67 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  42.67 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  41.56 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  36 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  37.84 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  42.19 
 
 		 86 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  42.62 
 
 		 82 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  35.38 
 
 		 72 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  34.38 
 
 		 80 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>