44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0907 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  96.3 
 
 		 81 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  85.14 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  81.82 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  85.14 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  85.14 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  85.14 
 
 		 75 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  85.14 
 
 		 80 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  80.26 
 
 		 84 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  78.21 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  81.08 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  73.75 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  71.6 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  78.67 
 
 		 79 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  76.92 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  56.58 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  52.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  52.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  52.56 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  52.56 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  53.95 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  53.95 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  53.95 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  53.95 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  57.97 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  52.63 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  59.09 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  48.68 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  48.65 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  48 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  50.82 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  43.08 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  47.06 
 
 		 207 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  38.1 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2172  hypothetical protein  34.18 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.722768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  38.57 
 
 		 213 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  41.43 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  33.85 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>