59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2425 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2425  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  34.81 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  34.07 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  29.84 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  27.74 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  27.74 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  31.19 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  31.39 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  31.39 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  28.68 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  28.23 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37320  hypothetical protein  29.37 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  26.36 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  27.94 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  29.23 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  26.87 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  25.55 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  26.43 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  26.62 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  26.87 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  24.03 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  26.62 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  25.62 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  26.61 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  25.95 
 
 		 183 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  25.55 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  30.48 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  24.09 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  25.71 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  26.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  27.91 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  23.7 
 
 		 301 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  24.82 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  24.82 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  26.28 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  25.68 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  23.91 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  24.59 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  25.81 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  23.36 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  25.4 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  26.06 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 172 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  25 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 203 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  24.06 
 
 		 169 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3202  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>