22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3202 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37320  hypothetical protein  91.37 
 
 		 158 aa  253  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  25.62 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  23.78 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  24.26 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2425  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  23.53 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  26.72 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  22.13 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  26.98 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  25.83 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  26.67 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  25.95 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  26.61 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  19.34 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.25 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  25.14 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  23.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  27.62 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  25.81 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  29.06 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  24.35 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>