65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0673 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  361  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  34.87 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  34.75 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  34.04 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  35.46 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.46 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  30.92 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  29.89 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  33.54 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  32.59 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  28.92 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  31.11 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  28.68 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  28.68 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.2 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  27.94 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  33.11 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  30.43 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  29.14 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  28.06 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  28.06 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  28.98 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  26.98 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  27.15 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  29.6 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  25.38 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  30 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  28.14 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  26.12 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  29.17 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  30.95 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  24.85 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  25.33 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  26.24 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  29.76 
 
 
226 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  26.98 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  26.9 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  27.2 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  25.45 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  28.23 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  27.66 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  26.4 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  26.52 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  26.24 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.56 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  24.26 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  26 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  25.18 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  25.86 
 
 
185 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  31.51 
 
 
182 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2425  hypothetical protein  26.56 
 
 
232 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236556  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37320  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494749  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  24.83 
 
 
204 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  24.03 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>