More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0623 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  57.36 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  58.14 
 
 
265 aa  308  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  55.12 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  58.66 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  57.36 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  54.12 
 
 
257 aa  298  8e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  51.71 
 
 
281 aa  291  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
277 aa  287  9e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 
248 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  48.18 
 
 
248 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
269 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
249 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
249 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  49.24 
 
 
265 aa  254  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  48.18 
 
 
248 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  250  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  250  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  47.84 
 
 
263 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
248 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  50.63 
 
 
262 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  46.67 
 
 
258 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  48.28 
 
 
265 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  49.37 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 
251 aa  244  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  44.44 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  47.06 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
249 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  46.96 
 
 
248 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  45.63 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
259 aa  241  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  46.53 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
250 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  45.31 
 
 
255 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
254 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  44.72 
 
 
249 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  46.15 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  47.03 
 
 
236 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  47.03 
 
 
236 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  47.03 
 
 
236 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  44.94 
 
 
251 aa  239  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
250 aa  238  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  44.98 
 
 
273 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  44.13 
 
 
251 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0975  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
250 aa  236  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
257 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  46.67 
 
 
260 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
264 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
259 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  45.12 
 
 
254 aa  235  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  42.34 
 
 
249 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
249 aa  235  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
260 aa  235  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  46.61 
 
 
254 aa  234  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  44.72 
 
 
248 aa  234  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  44.35 
 
 
249 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  46.4 
 
 
263 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  46.8 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  45.1 
 
 
256 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
257 aa  231  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  47.15 
 
 
253 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
254 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  44.08 
 
 
247 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
256 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
250 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  46 
 
 
256 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  45.93 
 
 
262 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  45.73 
 
 
236 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  44.18 
 
 
271 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1048  methionine aminopeptidase, type I  43.2 
 
 
272 aa  228  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  41.39 
 
 
249 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  44.58 
 
 
274 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  46.19 
 
 
236 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
260 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  42.17 
 
 
250 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  43.5 
 
 
261 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  44.18 
 
 
260 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  43.78 
 
 
260 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1447  methionine aminopeptidase  40.89 
 
 
248 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  39.76 
 
 
252 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  43.75 
 
 
272 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  43.62 
 
 
255 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  44.03 
 
 
252 aa  223  2e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
250 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  43.62 
 
 
260 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>