More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03977 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03977  transposase (IS4 family)  100 
 
 
141 aa  292  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02776  ISXo3 transposase ORF B  96.32 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00280  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00178  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01411  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.219199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02574  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01853  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02366  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02298  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00828  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00318868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04248  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00423  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06104  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
189 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00140  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00052  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01753  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01471  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01120  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03834  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.459443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00943  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
189 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04615  ISXo3 transposase ORF B  97.6 
 
 
158 aa  255  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.459846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02425  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
189 aa  253  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00417  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.263045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02731  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02740  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00370  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.327346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02583  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06241  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04443  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03450  transposase (IS4 family)  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04116  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01078  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03870  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  252  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03881  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358994  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04235  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06249  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0496588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01071  ISXo3 transposase ORF B  96.8 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05488  ISXo3 transposase ORF B  96 
 
 
158 aa  250  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.472662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03278  transposase (IS4 family)  96.8 
 
 
125 aa  250  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00048  ISXo3 transposase ORF B  96 
 
 
158 aa  248  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01884  ISXo3 transposase ORF B  95.2 
 
 
158 aa  246  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02487  transposase (IS4 family)  96.67 
 
 
143 aa  243  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06033  transposase (IS4 family)  96.67 
 
 
143 aa  243  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03293  transposase (IS4 family)  96.49 
 
 
125 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.606681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02645  ISXo3 transposase ORF A  98.17 
 
 
131 aa  223  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05575  ISXo3 transposase ORF A  97.85 
 
 
115 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01797  ISXo3 transposase ORF A  97.85 
 
 
115 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03792  ISXo3 transposase ORF A  97.85 
 
 
115 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04430  ISXo3 transposase ORF A  97.85 
 
 
115 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.865964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05781  putative transposase  94.38 
 
 
89 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1564  hypothetical protein  58.52 
 
 
174 aa  163  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.6846 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1510  hypothetical protein  58.52 
 
 
174 aa  163  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1713  hypothetical protein  57.78 
 
 
174 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1839  hypothetical protein  57.78 
 
 
174 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1851  hypothetical protein  57.78 
 
 
174 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1929  hypothetical protein  57.78 
 
 
174 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1702  hypothetical protein  56.3 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.628235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04604  transposase  96.15 
 
 
89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0335  transposase  53.33 
 
 
156 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0744  transposase  53.33 
 
 
156 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321514  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0746  transposase  53.33 
 
 
156 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.243384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0841  IS5 family transposase  59.57 
 
 
100 aa  120  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00551  transposase  94.64 
 
 
70 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4645  hypothetical protein  60.92 
 
 
139 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60619  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  38.97 
 
 
280 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  38.24 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  38.24 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 
274 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  37.5 
 
 
270 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02259  transposase  86 
 
 
52 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  36.76 
 
 
274 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  36.88 
 
 
265 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  36.3 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 
274 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  36.42 
 
 
280 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  40.44 
 
 
276 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  36.5 
 
 
278 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  38.24 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  39.42 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  39.42 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  34.56 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  37.96 
 
 
278 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
274 aa  80.5  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>