72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02254 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02254  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0982  protein of unknown function DUF886  68.38 
 
 
203 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.429638  normal  0.105211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5955  hypothetical protein  43.59 
 
 
190 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3904  hypothetical protein  29.69 
 
 
204 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4558  protein of unknown function DUF886  41.33 
 
 
183 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2653  protein of unknown function DUF886  54.39 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0159203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0248  hypothetical protein  38.74 
 
 
198 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3164  hypothetical protein  36.84 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3016  hypothetical protein  23 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1036  hypothetical protein  38.37 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.257872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1388  hypothetical protein  39.47 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0920868  hitchhiker  0.00023617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1080  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.62386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5034  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2588  hypothetical protein  35.63 
 
 
197 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5084  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2714  hypothetical protein  42.72 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3760  hypothetical protein  44.44 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0365  hypothetical protein  42.86 
 
 
198 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1255  protein of unknown function DUF886  46.67 
 
 
182 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0325  hypothetical protein  45.33 
 
 
187 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1335  hypothetical protein  36.84 
 
 
216 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6926  protein of unknown function DUF886  38.57 
 
 
191 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0684944  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4156  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.737957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4908  hypothetical protein  42.25 
 
 
190 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2219  hypothetical protein  47.22 
 
 
190 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2509  hypothetical protein  47.22 
 
 
190 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2110  putative cold inducible protein Ves  47.22 
 
 
190 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0875  hypothetical protein  39.73 
 
 
207 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1533  protein of unknown function DUF886  28.65 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0933  hypothetical protein  39.73 
 
 
207 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5173  hypothetical protein  41.43 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5931  protein of unknown function DUF886  38.67 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810198  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2853  hypothetical protein  46.55 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642703  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0164  hypothetical protein  38.89 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0359  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1294  hypothetical protein  38.67 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.070134  normal  0.0207913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0430  hypothetical protein  42.03 
 
 
190 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.359855  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2870  hypothetical protein  23 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.290412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2982  hypothetical protein  28.11 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1678  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2720  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2664  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2922  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2363  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.472112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0648  hypothetical protein  41.77 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1400  hypothetical protein  34.21 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2793  hypothetical protein  41.77 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1431  hypothetical protein  39.13 
 
 
195 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2962  hypothetical protein  41.18 
 
 
202 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  0.713874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3489  protein of unknown function DUF886  35.62 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0151  hypothetical protein  41.79 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5071  protein of unknown function DUF886  53.45 
 
 
181 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2080  hypothetical protein  51.79 
 
 
187 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4629  hypothetical protein  39.53 
 
 
181 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.355004  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1823  hypothetical protein  35.9 
 
 
222 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2944  hypothetical protein  43.1 
 
 
212 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1101  hypothetical protein  34.71 
 
 
217 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0858704  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1489  protein of unknown function DUF886  22.83 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.409079  normal  0.364485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5908  hypothetical protein  41.1 
 
 
207 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2169  hypothetical protein  41.1 
 
 
207 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2887  hypothetical protein  34.85 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0163  protein of unknown function DUF886  30.82 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1811  hypothetical protein  32.76 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120207  normal  0.474402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2186  hypothetical protein  38.36 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153791  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3647  hypothetical protein  38.33 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2208  hypothetical protein  35.44 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1702  hypothetical protein  40.28 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2085  hypothetical protein  39.71 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3002  hypothetical protein  41.27 
 
 
176 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.530397  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2794  protein of unknown function DUF886  37.04 
 
 
193 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2387  protein of unknown function DUF886  35.8 
 
 
192 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5479  hypothetical protein  40.58 
 
 
191 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>