108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0017 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  98.07 
 
 		 840 bp  1515    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  100 
 
 		 1017 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  100 
 
 		 978 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0017    100 
 
 		 937 bp  1857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0712662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  81.87 
 
 		 981 bp  303  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  81.87 
 
 		 981 bp  303  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  81.87 
 
 		 981 bp  303  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  81.87 
 
 		 981 bp  303  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  82.68 
 
 		 981 bp  295  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  82.89 
 
 		 981 bp  281  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    82.1 
 
 		 979 bp  268  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  82.99 
 
 		 984 bp  264  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24590  ISPssy, transposase  79.45 
 
 		 534 bp  168  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5627    91.89 
 
 		 495 bp  99.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  84.5 
 
 		 984 bp  97.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  89.16 
 
 		 981 bp  93.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  82.52 
 
 		 960 bp  85.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1779    89.71 
 
 		 275 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  81.41 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  82.35 
 
 		 963 bp  69.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  82.35 
 
 		 810 bp  69.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  83.67 
 
 		 981 bp  67.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  83.67 
 
 		 981 bp  67.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  83.17 
 
 		 924 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  95.12 
 
 		 963 bp  65.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  83.7 
 
 		 1218 bp  63.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  81.51 
 
 		 984 bp  61.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  81.51 
 
 		 990 bp  61.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5626    87.93 
 
 		 438 bp  60  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  82.65 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  90 
 
 		 996 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  90 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1626    85.39 
 
 		 1994 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.449305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2618    85.39 
 
 		 3623 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.941681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3753  putative transposase  84.42 
 
 		 468 bp  58  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 993 bp  58  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 981 bp  58  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  82.18 
 
 		 984 bp  58  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1381    87.5 
 
 		 1326 bp  56  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  81.03 
 
 		 1020 bp  56  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  92.31 
 
 		 951 bp  54  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    80.67 
 
 		 602 bp  54  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4648  transposase, IS4 family protein  89.36 
 
 		 705 bp  54  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.818744  normal  0.900302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  81.31 
 
 		 144 bp  54  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  89.36 
 
 		 216 bp  54  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  80.67 
 
 		 963 bp  54  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  94.29 
 
 		 963 bp  54  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  90.48 
 
 		 993 bp  52  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  88 
 
 		 924 bp  52  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  88.89 
 
 		 963 bp  50.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>