48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3789 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  98.5 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  81.95 
 
 		 265 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  80.45 
 
 		 267 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  80.69 
 
 		 276 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  79.62 
 
 		 265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  79.92 
 
 		 276 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  79.92 
 
 		 276 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  74.81 
 
 		 277 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  74.44 
 
 		 266 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  74.24 
 
 		 275 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  57.93 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  54.75 
 
 		 273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  55.3 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  56.06 
 
 		 284 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  56.02 
 
 		 274 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  54.92 
 
 		 271 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  57.71 
 
 		 286 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  53.38 
 
 		 315 aa  309  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  53.03 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  54.92 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  56.35 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  54.34 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  54.55 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  53.96 
 
 		 273 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  53.96 
 
 		 273 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  53.58 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  53.76 
 
 		 272 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  53.79 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  53.79 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  53.79 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  52.65 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  53.54 
 
 		 275 aa  291  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  50.97 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  48.51 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  44.44 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  44.44 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  42.35 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  35.91 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  38.49 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  38.13 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  24.53 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  25.13 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  28.93 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  25.63 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1077  hypothetical protein  28 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000260914  hitchhiker  0.0000000000012089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>