47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1050 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  80.52 
 
 
256 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  63.29 
 
 
250 aa  298  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  58.65 
 
 
251 aa  285  5e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  59.64 
 
 
225 aa  261  8.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  29.17 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  26.94 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  25.53 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  24.48 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  25.39 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  25.91 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  26.18 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  27.66 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  25.79 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  25.77 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  23.98 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  23.88 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  23.32 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  23.5 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  25.52 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  25.52 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  24.74 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  25.26 
 
 
272 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  27.27 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  25.77 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  23.81 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  25.52 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  25.13 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  25.13 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  26.32 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  24.47 
 
 
276 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  24.47 
 
 
276 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  23.94 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  23.94 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2741  hypothetical protein  38.82 
 
 
313 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  22.8 
 
 
272 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  25.39 
 
 
275 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  24.14 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  24.14 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  24.53 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1077  hypothetical protein  25.9 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000260914  hitchhiker  0.0000000000012089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2805  hypothetical protein  26.15 
 
 
295 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>