48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2166 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  55.47 
 
 
277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  56.78 
 
 
278 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  58.3 
 
 
267 aa  325  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  54.74 
 
 
275 aa  321  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  56.54 
 
 
266 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  55.85 
 
 
265 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  54.65 
 
 
276 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  53.9 
 
 
276 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  53.9 
 
 
276 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  56.02 
 
 
266 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  54.79 
 
 
265 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  56.02 
 
 
266 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  51.44 
 
 
283 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  51.65 
 
 
279 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  51.09 
 
 
286 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  50.74 
 
 
273 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  50.74 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  50.55 
 
 
271 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  50.18 
 
 
272 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  49.63 
 
 
274 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  50 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  48.89 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  49.03 
 
 
265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  49.82 
 
 
275 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  51.28 
 
 
273 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  49.64 
 
 
274 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  50.92 
 
 
274 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  50 
 
 
274 aa  278  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  51.28 
 
 
273 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  51.28 
 
 
273 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  51.28 
 
 
273 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  50.18 
 
 
274 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  48.91 
 
 
274 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  48.91 
 
 
280 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  48.31 
 
 
272 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  46.15 
 
 
274 aa  258  7e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  46.15 
 
 
274 aa  258  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  42.34 
 
 
264 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  40.22 
 
 
263 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  39.05 
 
 
264 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  34.81 
 
 
279 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  26.46 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  25.1 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  23.5 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  26.73 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  25.25 
 
 
225 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>