43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3440 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  62.91 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  55.72 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  51.97 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  50.92 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  50.18 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  48.91 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  49.82 
 
 		 274 aa  288  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  48.54 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  47.81 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  49.26 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  285  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  47.27 
 
 		 277 aa  284  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  49.1 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  49.09 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  49.09 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  48.71 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  46.13 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  47.94 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  49.82 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  48.69 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  49.44 
 
 		 265 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  48.31 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  48.91 
 
 		 274 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  50.39 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  46.52 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  48.51 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  48.13 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  46.91 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  47.25 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  40.07 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  40.07 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  41.33 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  37.82 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  35.02 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  30.8 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  24.9 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>