45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5134 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5924  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0748555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5258  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5134  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.855044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4946  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3381  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2058  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1089  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0726  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0834  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00573126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3377  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3677  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4795  ISPsy11, transposase OrfA  80.77 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4905  ISPsy11, transposase OrfA  77.42 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  77.42 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4510  ISPsy11, transposase OrfA  77.42 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0069  ISPsy11, transposase OrfA  73.77 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1346  ISPsy11, transposase OrfA  73.77 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2031  ISPsy11, transposase OrfA  73.77 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2130  ISPsy11, transposase OrfA  73.77 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2143  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000143266  hitchhiker  0.000251162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2297  ISPsy11, transposase OrfA  57.14 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3302  ISPsy11, transposase OrfA  57.14 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2127  ISPsy11, transposase OrfA  57.14 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0498042  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  54.72 
 
 		 405 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2470  IS3 family transposase orfA  54.55 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1225  ISPsy11, transposase OrfA  66.67 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0368564  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0758  ISPsy11, transposase OrfA  66.67 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3090  ISPsy11, transposase OrfA  66.67 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000160805  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  54.55 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  59.57 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3220  ISPsy11, transposase OrfA  59.57 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3618  ISPsy11, transposase OrfA  57.45 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  57.45 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  57.45 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  57.45 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  57.45 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0118  hypothetical protein  45.83 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.834355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0465  transposase  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>