82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2470 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  100 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2470  IS3 family transposase orfA  100 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0069  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1346  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184442  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2031  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2130  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4510  ISPsy11, transposase OrfA  55.17 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4905  ISPsy11, transposase OrfA  55.17 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  55.17 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5134  hypothetical protein  54.55 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.855044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5924  hypothetical protein  54.55 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0748555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5258  hypothetical protein  54.55 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4946  hypothetical protein  54.55 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1089  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0834  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00573126  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3381  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0726  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2058  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3377  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3677  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4795  ISPsy11, transposase OrfA  50 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3618  ISPsy11, transposase OrfA  62.79 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  62.79 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  62.79 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  62.79 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  62.79 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3090  ISPsy11, transposase OrfA  51.06 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000160805  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1225  ISPsy11, transposase OrfA  51.06 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0368564  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0758  ISPsy11, transposase OrfA  51.06 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3220  ISPsy11, transposase OrfA  57.78 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  57.78 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3302  ISPsy11, transposase OrfA  46.15 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2297  ISPsy11, transposase OrfA  46.15 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2127  ISPsy11, transposase OrfA  46.15 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0498042  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2143  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000143266  hitchhiker  0.000251162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000627522  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000418233  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  0.0000000637024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027279  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  42.11 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  42.11 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000548512  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1381  transposase  40.68 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0085723  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000501028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2793  transposase  40.68 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000040738  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  40.68 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  40.35 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  38.78 
 
 
409 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  38.78 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  38.78 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  38.78 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  38.78 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  38.78 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  38.78 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>