141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3339 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0465  transposase  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0573  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0389976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0682  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0798  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1018  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0189019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1623  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1976  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0455365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2331  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2572  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000021064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3083  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4069  transposase  96.06 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  60.77 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  60.77 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  60.77 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000627522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  60.77 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  60.77 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  0.0000000637024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  62.1 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  60 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  60 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  60 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  61.29 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  61.29 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000548512  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  61.29 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  60 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  60 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  61.29 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000418233  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  61.29 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  59.23 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  59.23 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  60.48 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  57.69 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  57.69 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  57.69 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000501028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0016  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0023  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0402  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1105  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1494  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1615  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1915  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.794502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2424  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2465  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.364332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3258  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3706  transposase  57.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0870  transposase  58.26 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1674  transposase  58.26 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2987  transposase  58.26 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  55.28 
 
 		 411 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  55.28 
 
 		 411 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  55.28 
 
 		 411 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  55.28 
 
 		 411 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  55.28 
 
 		 411 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  57.14 
 
 		 409 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  58.06 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0936  transposase orfA  55.46 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0716  putative transposase orfA  58.04 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  58.33 
 
 		 405 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2127  ISPsy11, transposase OrfA  58.2 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0498042  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2143  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000143266  hitchhiker  0.000251162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2297  ISPsy11, transposase OrfA  58.2 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3302  ISPsy11, transposase OrfA  58.2 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  53.6 
 
 		 132 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3220  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4442  transposase  53.15 
 
 		 135 aa  121  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1880  transposase  53.15 
 
 		 135 aa  121  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  53.45 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2793  transposase  56.12 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000040738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1381  transposase  56.12 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0085723  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  55.65 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4510  ISPsy11, transposase OrfA  55.65 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4905  ISPsy11, transposase OrfA  55.65 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3381  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4795  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1089  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0726  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2058  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3677  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3377  ISPsy11, transposase OrfA  52.59 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>