21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2076 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2076  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  897    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24510  hypothetical protein  89.89 
 
 		 455 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0136354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2436  hypothetical protein  31.62 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.421979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1901  hypothetical protein  37.01 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1734  hypothetical protein  36.79 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.996775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0770  putative transmembrane protein  33.25 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605451  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1967  transmembrane protein  29.72 
 
 		 459 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.240194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1645  hypothetical protein  33.06 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3203  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4158  hypothetical protein  30.04 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126391  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1040  putative transmembrane protein  33.25 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5543  putative transmembrane protein  31.3 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2273  hypothetical protein  29.27 
 
 		 483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272516  normal  0.14382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2471  putative transmembrane protein  28.76 
 
 		 491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5287  hypothetical protein  29.78 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.181524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1835  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229107  hitchhiker  0.000905688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2972  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0334342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1494  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 470 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0019  putative transmembrane protein  32.89 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0435379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0531  hypothetical protein  20.84 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00100701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  21.3 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>