20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0019 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0019  putative transmembrane protein  100 
 
 		 461 aa  902    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0435379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1835  putative transmembrane protein  35.6 
 
 		 471 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229107  hitchhiker  0.000905688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5287  hypothetical protein  35.5 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.181524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2972  putative transmembrane protein  34.3 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0334342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4158  hypothetical protein  36.06 
 
 		 487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126391  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1494  putative transmembrane protein  35.18 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2471  putative transmembrane protein  33.81 
 
 		 491 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0770  putative transmembrane protein  37.57 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605451  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1967  transmembrane protein  31.65 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.240194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2273  hypothetical protein  32.69 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272516  normal  0.14382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3203  putative transmembrane protein  32.53 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1040  putative transmembrane protein  33.84 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5543  putative transmembrane protein  32.49 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2436  hypothetical protein  30.4 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.421979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2076  hypothetical protein  32.3 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24510  hypothetical protein  31.74 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0136354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1901  hypothetical protein  32.36 
 
 		 443 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0531  hypothetical protein  20.34 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00100701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1734  hypothetical protein  29.09 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.996775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1645  hypothetical protein  24.04 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>