21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2076  hypothetical protein  89.89 
 
 		 455 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24510  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0136354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1901  hypothetical protein  37.75 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2436  hypothetical protein  33.25 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.421979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1734  hypothetical protein  37.79 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.996775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0770  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 464 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605451  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3203  putative transmembrane protein  32.51 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4158  hypothetical protein  31.72 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126391  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1645  hypothetical protein  33.24 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5543  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1967  transmembrane protein  27.85 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.240194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2471  putative transmembrane protein  30.63 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1835  putative transmembrane protein  31.08 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229107  hitchhiker  0.000905688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1040  putative transmembrane protein  32.37 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5287  hypothetical protein  30.16 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.181524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2273  hypothetical protein  28.82 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272516  normal  0.14382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2972  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0334342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1494  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0019  putative transmembrane protein  32.01 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0435379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0531  hypothetical protein  20.09 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00100701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2666  diguanylate cyclase  25.85 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>