20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2273 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2273  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  975    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272516  normal  0.14382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2471  putative transmembrane protein  83.48 
 
 		 491 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4158  hypothetical protein  56.99 
 
 		 487 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126391  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2972  putative transmembrane protein  46.84 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0334342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5287  hypothetical protein  45.53 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428811  normal  0.181524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1835  putative transmembrane protein  44.47 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229107  hitchhiker  0.000905688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1494  putative transmembrane protein  46.28 
 
 		 470 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0770  putative transmembrane protein  37.1 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605451  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1040  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 467 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3203  putative transmembrane protein  31.77 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5543  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1967  transmembrane protein  31.91 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.240194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0019  putative transmembrane protein  32.69 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0435379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2076  hypothetical protein  29.27 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24510  hypothetical protein  28.6 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0136354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1734  hypothetical protein  27.74 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.996775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1901  hypothetical protein  28.99 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0531  hypothetical protein  19.35 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00100701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2436  hypothetical protein  23.17 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.421979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1645  hypothetical protein  26.83 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>