30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3007 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  360  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2685  hypothetical protein  97.71 
 
 		 175 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3058  hypothetical protein  81.88 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3745  hypothetical protein  71.76 
 
 		 173 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265323  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0363  hypothetical protein  65.91 
 
 		 177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5175  hypothetical protein  66.48 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1271  hypothetical protein  67.11 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000775197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3806  hypothetical protein  67.55 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  0.271937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1961  hypothetical protein  64.07 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656827  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5291  hypothetical protein  60.24 
 
 		 238 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3549  hypothetical protein  59.04 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.512484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1353  hypothetical protein  44.51 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2457  hypothetical protein  36.14 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3698  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0351244  normal  0.838968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4996  hypothetical protein  42.26 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189156  normal  0.935959 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2290  hypothetical protein  38.52 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0966  hypothetical protein  38.52 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1052  hypothetical protein  38.52 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2092  hypothetical protein  34.97 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4854  hypothetical protein  35.9 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0865062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5447  hypothetical protein  36.92 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0237  hypothetical protein  36.23 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2141  hypothetical protein  33.56 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5428  hypothetical protein  35.06 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.231819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1608  hypothetical protein  36.99 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1711  hypothetical protein  30.84 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>