30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1711 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1711  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  316  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0966  hypothetical protein  67.08 
 
 
162 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2290  hypothetical protein  75.21 
 
 
174 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1052  hypothetical protein  73.55 
 
 
159 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4854  hypothetical protein  51.02 
 
 
172 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0865062  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5447  hypothetical protein  52.85 
 
 
172 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5415  hypothetical protein  52.85 
 
 
172 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5301  hypothetical protein  46.85 
 
 
178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.231819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4756  hypothetical protein  47.55 
 
 
178 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2092  hypothetical protein  47.1 
 
 
167 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0237  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4996  hypothetical protein  44 
 
 
184 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189156  normal  0.935959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2457  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4120  hypothetical protein  42.35 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3698  hypothetical protein  35.76 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0351244  normal  0.838968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5428  hypothetical protein  35.77 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2141  hypothetical protein  34.11 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3058  hypothetical protein  31.78 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3745  hypothetical protein  28.4 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265323  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3549  hypothetical protein  31.06 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.512484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2685  hypothetical protein  30.84 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5175  hypothetical protein  27.4 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1353  hypothetical protein  32.69 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1961  hypothetical protein  28.97 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656827  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0363  hypothetical protein  27.4 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3007  hypothetical protein  30.84 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5291  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1271  hypothetical protein  26.96 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000775197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3806  hypothetical protein  30.56 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  0.271937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1608  hypothetical protein  33.07 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>