30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2290 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2290  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1052  hypothetical protein  98.11 
 
 
159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0966  hypothetical protein  95.68 
 
 
162 aa  267  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1711  hypothetical protein  70.34 
 
 
155 aa  195  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5415  hypothetical protein  62.1 
 
 
172 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5447  hypothetical protein  62.1 
 
 
172 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4854  hypothetical protein  61.42 
 
 
172 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0865062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0237  hypothetical protein  61.54 
 
 
178 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4756  hypothetical protein  60 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5301  hypothetical protein  57.69 
 
 
178 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.231819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2092  hypothetical protein  49.7 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4996  hypothetical protein  47.67 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189156  normal  0.935959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2457  hypothetical protein  43.31 
 
 
176 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3698  hypothetical protein  43.79 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0351244  normal  0.838968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4120  hypothetical protein  40.15 
 
 
135 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3058  hypothetical protein  38.52 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5175  hypothetical protein  36.99 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0363  hypothetical protein  36.99 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2141  hypothetical protein  39.29 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3007  hypothetical protein  38.52 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2685  hypothetical protein  38.52 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5428  hypothetical protein  41.27 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1271  hypothetical protein  37.98 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000775197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3745  hypothetical protein  36.89 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265323  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3806  hypothetical protein  36.05 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  0.271937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1961  hypothetical protein  34.96 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656827  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1353  hypothetical protein  36.84 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5291  hypothetical protein  32.53 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1608  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3549  hypothetical protein  36.88 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.512484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>