30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2092 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2092  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1052  hypothetical protein  59.35 
 
 
159 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2290  hypothetical protein  58.54 
 
 
174 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0966  hypothetical protein  58.54 
 
 
162 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4854  hypothetical protein  56.15 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0865062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0237  hypothetical protein  50.32 
 
 
178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5415  hypothetical protein  57.48 
 
 
172 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5447  hypothetical protein  57.48 
 
 
172 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4756  hypothetical protein  54.07 
 
 
178 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5301  hypothetical protein  48.15 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.231819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4996  hypothetical protein  42.53 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189156  normal  0.935959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1711  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2457  hypothetical protein  39.38 
 
 
176 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4120  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3698  hypothetical protein  40.94 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0351244  normal  0.838968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5428  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2141  hypothetical protein  36.96 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3745  hypothetical protein  36.25 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265323  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3007  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2685  hypothetical protein  35.71 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5175  hypothetical protein  35.46 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0363  hypothetical protein  34.75 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3058  hypothetical protein  34.29 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1353  hypothetical protein  35.42 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1608  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3806  hypothetical protein  36.05 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  0.271937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1961  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656827  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1271  hypothetical protein  30.88 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000775197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3549  hypothetical protein  35.4 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.512484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5291  hypothetical protein  31.47 
 
 
238 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>