34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89833 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_89833  SPT3 Dosage dependent suppressor of Ty-induced promoter mutations-like protein  100 
 
 
1165 aa  2397    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.637911  hitchhiker  0.00744791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01039  membrane-tethered transcription factor (SPT23), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12550)  32.54 
 
 
1393 aa  135  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06520  suppressor protein SPT23, putative  26.59 
 
 
1417 aa  88.2  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.02 
 
 
1402 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  40.28 
 
 
1005 aa  51.6  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  30 
 
 
395 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  42.47 
 
 
335 aa  50.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  36.92 
 
 
450 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  33.8 
 
 
185 aa  50.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  33.8 
 
 
185 aa  50.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.18 
 
 
2413 aa  49.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02797  NACHT and Ankyrin domain protein (JCVI)  35.71 
 
 
1579 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.131721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  33.33 
 
 
284 aa  48.5  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  33.33 
 
 
162 aa  48.5  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  29.49 
 
 
226 aa  48.5  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  29.63 
 
 
284 aa  48.5  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  35.06 
 
 
426 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  33.82 
 
 
217 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  27.86 
 
 
1053 aa  48.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  38.67 
 
 
811 aa  47.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  33.85 
 
 
404 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  33.33 
 
 
248 aa  47.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  28.4 
 
 
291 aa  47  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  32.26 
 
 
4520 aa  46.6  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  31.34 
 
 
138 aa  46.2  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  39.06 
 
 
541 aa  46.2  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  29.89 
 
 
257 aa  46.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1878  hypothetical protein  36.9 
 
 
806 aa  46.2  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 
2042 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29424  predicted protein  26.76 
 
 
565 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  34.85 
 
 
723 aa  45.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  35.21 
 
 
511 aa  45.1  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  29.33 
 
 
293 aa  45.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32 
 
 
2171 aa  44.7  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>