22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89181 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  69.35 
 
 
451 aa  641    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  75.96 
 
 
449 aa  711    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  69.42 
 
 
447 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  100 
 
 
448 aa  937    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  75.17 
 
 
448 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  70.52 
 
 
451 aa  631  1e-180  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  70.18 
 
 
452 aa  634  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  57.4 
 
 
389 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  41.86 
 
 
447 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  41.7 
 
 
447 aa  363  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  42.73 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  42.03 
 
 
447 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  40.18 
 
 
448 aa  350  4e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  42.59 
 
 
452 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  40.88 
 
 
447 aa  345  7e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  39.49 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  33.04 
 
 
448 aa  252  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  31.52 
 
 
454 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  32.96 
 
 
468 aa  249  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  49.35 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.797796 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  30.02 
 
 
449 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  29.25 
 
 
375 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>