23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06670 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  100 
 
 		 452 aa  939    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  59.01 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  59.63 
 
 		 447 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  60.14 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  58.43 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  57.85 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  57.61 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  54.71 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  42.83 
 
 		 448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  42.48 
 
 		 451 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  42.15 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  40.59 
 
 		 449 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  41.04 
 
 		 447 aa  339  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  41.2 
 
 		 451 aa  339  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  41.57 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  34.02 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  34.55 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  35.32 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  33.56 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  39.65 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  30.98 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.13 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.797796 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24594  predicted protein  26.72 
 
 		 333 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30003  normal  0.449043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>