22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02810 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  72.07 
 
 
451 aa  675    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  69.84 
 
 
451 aa  657    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  80 
 
 
449 aa  739    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  73.41 
 
 
447 aa  686    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  73.73 
 
 
452 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  75.17 
 
 
448 aa  701    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  100 
 
 
448 aa  937    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  58.93 
 
 
389 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  39.96 
 
 
447 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  41.14 
 
 
447 aa  360  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  40.42 
 
 
444 aa  350  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  41.07 
 
 
448 aa  349  7e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  42.59 
 
 
452 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  39.72 
 
 
449 aa  346  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  39.72 
 
 
447 aa  345  8.999999999999999e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  40.32 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  32.43 
 
 
454 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  33.11 
 
 
448 aa  256  4e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  32.43 
 
 
449 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  33.33 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  48.05 
 
 
353 aa  233  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.797796 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  31.32 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>