22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12139 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  77.25 
 
 
447 aa  724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  93.02 
 
 
444 aa  830    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  79.95 
 
 
447 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  100 
 
 
447 aa  941    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  73.64 
 
 
448 aa  684    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  77.6 
 
 
447 aa  724    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  75.11 
 
 
449 aa  688    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  57.61 
 
 
452 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  42.4 
 
 
451 aa  363  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  40.76 
 
 
447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  40.31 
 
 
452 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  41.74 
 
 
448 aa  355  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  39.73 
 
 
448 aa  352  8.999999999999999e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  40.09 
 
 
451 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  40.09 
 
 
449 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  35.53 
 
 
454 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  34.4 
 
 
448 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  34.4 
 
 
449 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  34.61 
 
 
468 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  36.22 
 
 
389 aa  266  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  28.03 
 
 
375 aa  156  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.7 
 
 
353 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.797796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>