22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84476 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  68.55 
 
 		 447 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  71.4 
 
 		 444 aa  667    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  74.13 
 
 		 447 aa  678    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  81.4 
 
 		 447 aa  712    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  100 
 
 		 448 aa  937    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  75.98 
 
 		 447 aa  702    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  75.97 
 
 		 449 aa  682    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  59.95 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  40.85 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  40.78 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  41.07 
 
 		 448 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  40.18 
 
 		 448 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  38.69 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  38.94 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  38.44 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  36.3 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  36.66 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  35.86 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  34.4 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  37.76 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  28.95 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.57 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.797796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>