102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49751 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_49751  predicted protein  100 
 
 		 451 aa  924    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50480  predicted protein  24.07 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  25.18 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  25.39 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0478  rod shape-determining protein MreB  25.1 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.515343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  28.49 
 
 		 350 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  26.21 
 
 		 349 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  26.21 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  26.21 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0420  rod shape-determining protein MreB  25.39 
 
 		 342 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0445177  hitchhiker  0.000156302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  26.21 
 
 		 349 aa  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  27.88 
 
 		 347 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  25.77 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000427845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  24.03 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  26.11 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  25.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0483  rod shape-determining protein MreB  24.07 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.025319  normal  0.0218935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  26.92 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  23.83 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  23.83 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  21.71 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  29.93 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  27.78 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  26.47 
 
 		 335 aa  47  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  21.71 
 
 		 347 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  25.56 
 
 		 347 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  24.89 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  31.03 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  25.24 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  27.01 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  21.32 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  28.21 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  32.35 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  28.21 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  28.21 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  26.11 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  21.32 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  23.6 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  24.77 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  21.32 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  25.23 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1210  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  25.13 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00104336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  22.22 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  22.22 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  25 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  29.52 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  28.12 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  26.99 
 
 		 347 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  25 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  26.67 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0665  rod shape-determining protein MreB  26.7 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000200896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  30 
 
 		 345 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  23.83 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  23.83 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  26.22 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  27.56 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  24.16 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  24.72 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  26.77 
 
 		 351 aa  43.9  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  29.47 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  30.1 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  26.67 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  28.57 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0514  rod shape-determining protein MreB  23.17 
 
 		 348 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  25.16 
 
 		 347 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>