26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43619 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11048  predicted protein  37.5 
 
 
136 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  28.37 
 
 
151 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  31.65 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  30.94 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 
147 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  31.11 
 
 
151 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  27.33 
 
 
157 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  28.89 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  29.17 
 
 
150 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  30.15 
 
 
145 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  28.47 
 
 
150 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  25.36 
 
 
156 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  25.19 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  31.06 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  23.78 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  23.78 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  25.58 
 
 
156 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 
148 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  23.66 
 
 
156 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  29.03 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  26.59 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  27.97 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 
337 aa  41.6  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>