More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29004 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_29004  predicted protein  100 
 
 
378 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18323  predicted protein  45.91 
 
 
288 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  36.84 
 
 
259 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  38.56 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  36.92 
 
 
266 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  36.96 
 
 
267 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  34.88 
 
 
267 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  36.46 
 
 
259 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  35.13 
 
 
268 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  34.51 
 
 
262 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  37.4 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  34.29 
 
 
267 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  30.8 
 
 
269 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  33.93 
 
 
267 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.26 
 
 
263 aa  156  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  34.33 
 
 
271 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  33.93 
 
 
267 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  33.93 
 
 
267 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  27.05 
 
 
265 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  33.45 
 
 
262 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  32.26 
 
 
266 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  32.86 
 
 
267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  37.6 
 
 
315 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  35.44 
 
 
267 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0555  inositol monophosphatase  32.19 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.903783  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  33.81 
 
 
267 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  33.81 
 
 
267 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  35.09 
 
 
283 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  33.81 
 
 
267 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  33.81 
 
 
267 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0538  Inositol-phosphate phosphatase  32.19 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
263 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  33.92 
 
 
266 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  34.6 
 
 
267 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  35.11 
 
 
258 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  34.16 
 
 
267 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  34.16 
 
 
267 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  33.1 
 
 
255 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  31.93 
 
 
262 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  33.91 
 
 
267 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  33.56 
 
 
284 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  34.29 
 
 
255 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  33.91 
 
 
267 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  33.91 
 
 
267 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2582  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.92 
 
 
273 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  34.26 
 
 
267 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  33.56 
 
 
267 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  33.56 
 
 
267 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1050  Inositol-phosphate phosphatase  38.87 
 
 
279 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0967  Inositol-phosphate phosphatase  36.86 
 
 
264 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  34.26 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.22 
 
 
282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  32.74 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  30.36 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  34.26 
 
 
267 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  35.56 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  32.97 
 
 
272 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  32.06 
 
 
431 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  34.02 
 
 
271 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  35.27 
 
 
261 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  33.76 
 
 
267 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  35 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.36 
 
 
263 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  32.53 
 
 
266 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.75 
 
 
267 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  33.56 
 
 
267 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  33.56 
 
 
268 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0511  Inositol-phosphate phosphatase  29.66 
 
 
272 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  33.33 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3902  Inositol-phosphate phosphatase  30.21 
 
 
279 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0888  inositol monophosphatase  30.34 
 
 
269 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0122019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.15 
 
 
265 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.9 
 
 
268 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0995  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
291 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.050858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  34.12 
 
 
271 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  32.62 
 
 
267 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  33.09 
 
 
270 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  32.62 
 
 
266 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  33.09 
 
 
270 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  31.9 
 
 
261 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  31.9 
 
 
261 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  31.8 
 
 
363 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.97 
 
 
267 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  34.78 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  35.74 
 
 
269 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  34.69 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  34.78 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  34.78 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  33.22 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>