53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14927 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_14927  predicted protein  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30187  predicted protein  40.96 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63502  Frataxin homolog, mitochondrial precursor Contains: Frataxin homolog intermediate form  42.86 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06050  hypothetical protein  42.47 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.631443  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01986  mitochondrial chaperone Frataxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10510)  39.44 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546286  normal  0.048197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4131  frataxin family protein  27.59 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.86894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0442  frataxin family protein  26.44 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2977  frataxin-like protein  29.07 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0320  frataxin family protein  27.91 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0312  cyaY protein  27.38 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3252  CyaY protein  30.43 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0691  CyaY protein  27.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.218617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0269  frataxin-like protein  28.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6018  frataxin-like protein  31.94 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0230  iron donor protein CyaY  30.12 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0390  frataxin family protein  27.59 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0388  frataxin family protein  27.59 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.867162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3636  frataxin family protein  27.59 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.968946  normal  0.703584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0180  frataxin-like protein  29.27 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3976  frataxin family protein  26.44 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3899  iron donor protein CyaY  26.44 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.14365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4092  frataxin family protein  26.44 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3998  frataxin family protein  26.44 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5286  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2396  frataxin-like protein  30.23 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.438011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0539  frataxin-like protein  26.51 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0227  cyaY protein  29.27 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5496  frataxin-like protein  26.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4311  cyay protein  26.44 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4013  frataxin-like protein  26.51 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0485  iron donor protein CyaY  26.44 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0203  frataxin-like protein  26.51 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0389  frataxin-like protein  25.29 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3585  frataxin family protein  26.44 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0779  frataxin-like  28.74 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0247  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.591263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47670  frataxin-like protein  26.19 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1138  iron donor protein CyaY  32.56 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5225  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.531989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0181  iron donor protein CyaY  26.74 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5134  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3977  frataxin-like protein  25.3 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69640  frataxin-like protein  31.71 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.735787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0375  frataxin family protein  25.29 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3409  iron donor protein CyaY  24.42 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000205462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3255  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2908  frataxin-like protein  27.91 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0346  frataxin-like  27.91 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4168  frataxin-like protein  28.79 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5583  iron donor protein CyaY  26.74 
 
 		 112 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0180  frataxin-like protein  27.71 
 
 		 106 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00312  frataxin-like protein  26.51 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0670  frataxin family protein  26.44 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  0.139029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>