49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30187 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_30187  predicted protein  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63502  Frataxin homolog, mitochondrial precursor Contains: Frataxin homolog intermediate form  38.46 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157875  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14927  predicted protein  40.96 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0312  cyaY protein  34.74 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01986  mitochondrial chaperone Frataxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10510)  30.3 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546286  normal  0.048197 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06050  hypothetical protein  34.29 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.631443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0375  frataxin family protein  31.37 
 
 
109 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0691  CyaY protein  31.96 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.218617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0442  frataxin family protein  34.09 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0247  frataxin-like protein  33.66 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.591263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0320  frataxin family protein  28.43 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5225  frataxin-like protein  32.67 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.531989  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5134  frataxin-like protein  32.67 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2396  frataxin-like protein  33.73 
 
 
104 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.438011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0227  cyaY protein  36.49 
 
 
110 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1194  iron donor protein CyaY  37.5 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.983196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3899  iron donor protein CyaY  25.96 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.14365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3998  frataxin family protein  25.96 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4311  cyay protein  32.93 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0269  frataxin-like protein  30.69 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4092  frataxin family protein  25.96 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3976  frataxin family protein  25.96 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4131  frataxin family protein  31.71 
 
 
109 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.86894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3252  CyaY protein  34.15 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0485  iron donor protein CyaY  29.29 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5496  frataxin-like protein  33.33 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3585  frataxin family protein  31.71 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5286  frataxin-like protein  30.69 
 
 
110 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0180  frataxin-like protein  32.61 
 
 
110 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0390  frataxin family protein  30.49 
 
 
109 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3636  frataxin family protein  30.49 
 
 
109 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.968946  normal  0.703584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0388  frataxin family protein  30.49 
 
 
109 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.867162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2908  frataxin-like protein  24.76 
 
 
128 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0389  frataxin-like protein  26 
 
 
111 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0203  frataxin-like protein  31.87 
 
 
107 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3255  frataxin-like protein  26.19 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0230  iron donor protein CyaY  31.87 
 
 
106 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4013  frataxin-like protein  33.77 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0227  CyaY protein  25.93 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0539  frataxin-like protein  33.77 
 
 
106 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6018  frataxin-like protein  31.71 
 
 
108 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2977  frataxin-like protein  30.59 
 
 
113 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47670  frataxin-like protein  32.79 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0124  frataxin-like protein  29.47 
 
 
104 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5583  iron donor protein CyaY  30.49 
 
 
112 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0181  iron donor protein CyaY  29.67 
 
 
106 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00312  frataxin-like protein  30 
 
 
104 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0779  frataxin-like  26.83 
 
 
116 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002108  frataxin CyaY  30 
 
 
104 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>