48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0312 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0312  cyaY protein  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0691  CyaY protein  74.31 
 
 		 109 aa  173  5e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.218617  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30187  predicted protein  34.74 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06050  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.631443  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63502  Frataxin homolog, mitochondrial precursor Contains: Frataxin homolog intermediate form  29.29 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3977  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0247  frataxin-like protein  30.77 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.591263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5134  frataxin-like protein  29.67 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14927  predicted protein  27.38 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4270  frataxin-like protein  29.89 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5225  frataxin-like protein  29.67 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.531989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4153  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3115  CyaY protein  29.47 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4028  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0230  iron donor protein CyaY  27.59 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5496  frataxin-like protein  28.09 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4329  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4222  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5286  frataxin-like protein  28.57 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4168  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0269  frataxin-like protein  31.08 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3985  frataxin-like protein  29.89 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47670  frataxin-like protein  27.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0181  iron donor protein CyaY  26.44 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0227  CyaY protein  28.09 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1194  iron donor protein CyaY  26.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.983196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4013  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0375  frataxin family protein  32.32 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0539  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0203  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5583  iron donor protein CyaY  25.88 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6018  frataxin-like protein  30.51 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03682  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4172  iron donor protein CyaY  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0793818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0227  cyaY protein  25.56 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03631  hypothetical protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.190762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5245  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4322  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0180  frataxin-like protein  30.11 
 
 		 106 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4266  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3409  iron donor protein CyaY  22.55 
 
 		 128 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000205462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4172  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4200  frataxin-like protein  28.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69640  frataxin-like protein  30.36 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.735787  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01986  mitochondrial chaperone Frataxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10510)  26.67 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546286  normal  0.048197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2396  frataxin-like protein  26.6 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.438011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0180  frataxin-like protein  28.38 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4170  frataxin-like protein  27.59 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>