105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0346 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0346  frataxin-like  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0075  cyaY protein  53.85 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0230  iron donor protein CyaY  53.33 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0203  frataxin-like protein  52.83 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.59151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0539  frataxin-like protein  54.29 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4013  frataxin-like protein  54.29 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3977  frataxin-like protein  53.33 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0181  iron donor protein CyaY  48.57 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4222  frataxin-like protein  51.43 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0390  frataxin family protein  45.79 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3636  frataxin family protein  45.79 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.968946  normal  0.703584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0388  frataxin family protein  45.79 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.867162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4168  frataxin-like protein  51.43 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0180  frataxin-like protein  50.94 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4153  frataxin-like protein  51.43 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4028  frataxin-like protein  50.48 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4329  frataxin-like protein  50.48 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0042  frataxin family protein  48.57 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175622  hitchhiker  0.00555697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4270  frataxin-like protein  50.48 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3585  frataxin family protein  43.93 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4311  cyay protein  43.93 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4131  frataxin family protein  45.79 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.86894 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3998  frataxin family protein  42.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3976  frataxin family protein  42.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4092  frataxin family protein  42.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3899  iron donor protein CyaY  42.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.14365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2800  frataxin-like protein  44.55 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0485  iron donor protein CyaY  44.86 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0305  frataxin-like protein  45.28 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0314  frataxin-like protein  45.28 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0353  frataxin-like protein  44.66 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0287  frataxin-like protein  43.4 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105821  normal  0.61824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3485  frataxin-like protein  42.2 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3604  frataxin-like protein  43.69 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0010997  hitchhiker  0.000000104783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2396  frataxin-like protein  40.78 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.438011  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2721  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0442  frataxin family protein  41.75 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0386  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0365  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0320  frataxin family protein  44.44 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0375  frataxin family protein  42.86 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2754  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3735  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3199  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1895  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.89819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3706  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3764  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3449  frataxin-like protein  42.45 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03682  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4172  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03631  hypothetical protein  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.190762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4172  iron donor protein CyaY  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3030  frataxin-like protein  41.51 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4322  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4200  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3252  CyaY protein  38.89 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4266  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4170  frataxin-like protein  48.57 
 
 		 106 aa  95.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3985  frataxin-like protein  49.52 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0389  frataxin-like protein  38.68 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0124  frataxin-like protein  43.88 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5245  frataxin-like protein  48.57 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00312  frataxin-like protein  42.27 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002108  frataxin CyaY  41.24 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3409  iron donor protein CyaY  38.74 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000205462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0832  iron donor protein CyaY  37.04 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2977  frataxin-like protein  39.25 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6018  frataxin-like protein  38.68 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47670  frataxin-like protein  33.96 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3115  CyaY protein  36.04 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1138  iron donor protein CyaY  35.19 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1712  frataxin-like protein  37.5 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.663673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2917  frataxin-like  36.19 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0779  frataxin-like  35.45 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0994  frataxin family protein  32.71 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5583  iron donor protein CyaY  32.73 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69640  frataxin-like protein  39.62 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.735787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0024  frataxin family protein  31.78 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3255  frataxin-like protein  35.19 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2908  frataxin-like protein  35.19 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5496  frataxin-like protein  30.19 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0247  frataxin-like protein  36.14 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.591263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0269  frataxin-like protein  36.36 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0697  iron donor protein CyaY  30.56 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0728  frataxin family protein  30.56 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.492597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0670  frataxin family protein  32.41 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5225  frataxin-like protein  33.73 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.531989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0227  cyaY protein  38.03 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5134  frataxin-like protein  33.73 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0180  frataxin-like protein  36.62 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0208  frataxin-like  32.65 
 
 		 105 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5286  frataxin-like protein  32.53 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0087  frataxin family protein  31.25 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3137  frataxin-like protein  41.18 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0227  CyaY protein  32.04 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0084  iron donor protein CyaY  33.96 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3275  frataxin-like protein  38.57 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1852  iron donor protein CyaY  32.29 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2195  cyaY protein  32.29 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1194  iron donor protein CyaY  33.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.983196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>