19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12516 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12516  predicted protein  100 
 
 		 147 aa  308  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04230  spliceosomal zinc finger-containing protein, putative  46.9 
 
 		 329 aa  124  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5242  predicted protein  43.75 
 
 		 237 aa  123  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.255836  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07755  Pre-mRNA-splicing factor cwc24 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVC5]  42.55 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00261014  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54326  GNAT family acetyltransferase with 2 zinc fingers  32.12 
 
 		 221 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  42.37 
 
 		 373 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05961  ATP-dependent protease (CrgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10470)  41.46 
 
 		 623 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.870505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50465  predicted protein  25.71 
 
 		 989 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00500  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 666 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31983  DNA repair protein and ATPase  38.64 
 
 		 474 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.812011 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07309  Postreplication repair E3 ubiquitin-protein ligase rad18 (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q02398]  41.03 
 
 		 443 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26544  predicted protein  37.78 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.295366  normal  0.0215447 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1761 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05870  expressed protein  29.17 
 
 		 470 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83076  predicted protein  51.85 
 
 		 470 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.569663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02470  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 820 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44747  predicted protein  44.12 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0219967  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49232  predicted protein  32.2 
 
 		 780 aa  40  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36517  predicted protein  36.73 
 
 		 170 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>