16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31983 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_31983  DNA repair protein and ATPase  100 
 
 		 474 aa  971    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.812011 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07309  Postreplication repair E3 ubiquitin-protein ligase rad18 (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q02398]  27.34 
 
 		 443 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28951  predicted protein  24.36 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43821  predicted protein  33.33 
 
 		 631 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  43.18 
 
 		 1415 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  35.42 
 
 		 972 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1761 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  36.73 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04000  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0012462  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05961  ATP-dependent protease (CrgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10470)  32.5 
 
 		 623 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.870505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26544  predicted protein  38.18 
 
 		 192 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.295366  normal  0.0215447 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02470  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 820 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58365  predicted protein  31.58 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92878  predicted protein  34.85 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1562  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32738  predicted protein  31.46 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167688  normal  0.331244 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12516  predicted protein  38.64 
 
 		 147 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>