17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12456 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  100 
 
 
283 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51797  frustulin 3  55.42 
 
 
386 aa  335  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14760  predicted protein  46.34 
 
 
415 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48579  predicted protein  50.18 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000247197  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48054  frustulin 2  41.08 
 
 
482 aa  175  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  43.18 
 
 
1000 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  49.25 
 
 
504 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  42.86 
 
 
407 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  35.24 
 
 
1217 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  30.21 
 
 
928 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  44.62 
 
 
551 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  41.54 
 
 
840 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  31.91 
 
 
1281 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  54.9 
 
 
136 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  45.16 
 
 
555 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  42.59 
 
 
472 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>