23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20041  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  22.58 
 
 		 445 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  22.78 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  23.11 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  21.49 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  22.93 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  22.98 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  21.74 
 
 		 480 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  21.81 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  20.89 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  29.76 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  21.62 
 
 		 470 aa  57.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  19.95 
 
 		 436 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  27.98 
 
 		 438 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  31.88 
 
 		 445 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  30.77 
 
 		 442 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  21.14 
 
 		 462 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  28.74 
 
 		 482 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  22.27 
 
 		 484 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  28.68 
 
 		 482 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.79 
 
 		 826 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  26.23 
 
 		 465 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.53 
 
 		 479 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>