19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1348 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1348  transmembrane prediction  100 
 
 		 460 aa  919    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0690  transmembrane prediction  46.81 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1901  putative nucleoside transport protein  35.95 
 
 		 578 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0778  transmembrane prediction  36.77 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00747802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26970  hypothetical protein-transmembrane prediction  36.21 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01745  hypothetical protein  31.76 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000173676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02311  hypothetical protein  48.09 
 
 		 173 aa  103  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7829  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.75 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.77 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0676  NCS1 nucleoside transporter  33.04 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.94 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  25.86 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  26.39 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  26.39 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  26.39 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  26.39 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  26.39 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  25.86 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>