16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2561 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  342  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  83.82 
 
 
173 aa  290  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  63.58 
 
 
251 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  63.22 
 
 
174 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  62.07 
 
 
174 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  64.75 
 
 
123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  37.04 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  37.04 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  32.8 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  35.2 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  35.2 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  34.4 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  35.34 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  35.33 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  28.22 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>