22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0544 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  97.87 
 
 
188 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  75 
 
 
193 aa  299  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  75.4 
 
 
188 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  62.77 
 
 
188 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  62.77 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  62.77 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  54.64 
 
 
187 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  35.07 
 
 
172 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  37.04 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  36.51 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0362  hypothetical protein  40.3 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  31.97 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2247  hypothetical protein  31.71 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal  0.285933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  42.25 
 
 
123 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  32.62 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  31.91 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0638  hypothetical protein  23.08 
 
 
231 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0896  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725187  normal  0.768997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0856  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0173682  normal  0.0897028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>