19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1686 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  63.11 
 
 		 173 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  62.9 
 
 		 174 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  64.75 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  65.32 
 
 		 251 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  66.13 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  66.94 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  33.68 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  34.74 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  34.74 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  36.3 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  31.2 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  28.04 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0896  hypothetical protein  51.22 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725187  normal  0.768997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0856  hypothetical protein  51.22 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0173682  normal  0.0897028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>