22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0478 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  75.94 
 
 		 188 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  72.92 
 
 		 193 aa  298  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  75.4 
 
 		 188 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  59.12 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  59.12 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  59.12 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  54.95 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  34.24 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  31.76 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  35.33 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0362  hypothetical protein  35.25 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2247  hypothetical protein  32.79 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal  0.285933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  32.61 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  30.09 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  31.58 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  31.35 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  38.03 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0856  hypothetical protein  34.85 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0173682  normal  0.0897028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0896  hypothetical protein  34.85 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725187  normal  0.768997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0638  hypothetical protein  27.45 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>