18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1345 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  82.18 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  79.31 
 
 		 251 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  68.39 
 
 		 174 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  62.64 
 
 		 173 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  62.07 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  66.94 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  32.04 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  27.97 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  31.64 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  32.5 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  32.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  28.18 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0856  hypothetical protein  35.58 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0173682  normal  0.0897028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>