22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0410 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  94.15 
 
 		 188 aa  336  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  62.77 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  62.77 
 
 		 188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  58.33 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  63.98 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  59.12 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  31.72 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  32.18 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  32.11 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  30.16 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0362  hypothetical protein  34.09 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  32.26 
 
 		 251 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2247  hypothetical protein  34.09 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal  0.285933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  30.65 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  39.44 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0896  hypothetical protein  41.46 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725187  normal  0.768997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0856  hypothetical protein  41.46 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0173682  normal  0.0897028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  34.03 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0638  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>