17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4113 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1851  hypothetical protein  90.8 
 
 		 174 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  decreased coverage  0.000510248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1345  hypothetical protein  79.31 
 
 		 174 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4709  hypothetical protein  68.21 
 
 		 174 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3183  hypothetical protein  63.79 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.960217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2561  hypothetical protein  63.58 
 
 		 173 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1686  hypothetical protein  65.32 
 
 		 123 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0591  hypothetical protein  34.22 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627569  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0544  hypothetical protein  33.69 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00280835  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0968  hypothetical protein  31.38 
 
 		 193 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0478  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0717  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0410  hypothetical protein  32.26 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.199826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0418  hypothetical protein  32.26 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0526  hypothetical protein  30.65 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0391  hypothetical protein  25.47 
 
 		 172 aa  42.4  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.162072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0822  hypothetical protein  55 
 
 		 167 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195979  normal  0.349326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>